eSet
Die Klasse eSet ist eine virtuelle S4-Klasse, die
die Grundlage für verschiedene andere Klassen bildet und für die viele Methoden
definiert sind. In Objekten einer auf eSet
basierenden Klasse lassen sich alle relevanten Informationen eines
Massendatenexperiments gebündelt ablegen: Expressionsdaten, Metadaten zur Beschreibung
des Experiments, Annotationen zum verwendeten Chip oder zur Technologie und eine
Beschreibung des Experiments selbst.
Von eSet sind viele andere Klassen abgeleitet: In
Biobase selbst sind die Klassen ExpressionSet und MultiSet (beide für High-Throughput-Expression-Assays), SnpSet (für High-Throughput-SNP-Assays) und NChannelSet (für Multichannel-Arrays) von eSet abgeleitet. Im affy-Paket erbt AffyBatch (zur Repräsentation ...
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