R in a Nutshell

Phänotypdaten zuordnen

Weder die CEL-Dateien noch die vorverarbeiteten Series-Matrix-Dateien von GEO enthalten experimentelle oder, anders ausgedrückt, nicht-genanalytische Informationen über die Beobachtungen. Im Abschnitt „Überlebensanalyse“ haben wir dagegen mit einem GEO-Datensatz gearbeitet, der genau diese experimentellen Daten enthält, einschließlich eines Indikators, der besagt, ob die betreffende Patientin einen Rückfall erlitten hat oder nicht und wie viel Zeit bis zur Rückfalldiagnose oder Kontrolluntersuchung verstrichen war. Derselbe Datenrahmen übrigens, den wir im Abschnitt „Laden von Intensitätsdaten“ benutzt haben, um die Zufallsstichprobe der Intensitätsdaten zusammenzustellen.

Als Erstes fügen wir diese klinischen Informationen ...