Kapitel 24. Bioconductor

Die meisten der in diesem Buch vorgestellten Techniken lassen sich in unterschiedlichen Arbeitsfeldern einsetzen. Im vorliegenden Kapitel konzentrieren wir uns jedoch auf ein ganz bestimmtes Gebiet, die Bioinformatik. Im Besonderen werden wir uns dabei mit dem Bioconductor-Projekt befassen (http://www.bioconductor.org). Der Bioconductor ist ein Open Source-Projekt zur Analyse von Gendaten mit R. Ursprünglich befasste man sich nur damit, Genexpressionsdaten zu untersuchen, mittlerweile existieren aber auch Werkzeuge zur Verarbeitung anderer Datenquellen, beispielsweise zur seriellen Analyse der Genexpression (SAGE), zur Proteomanalyse, zur SNP-Analyse (Single Nucleotide Polymorphism) und zur Gensequenzanalyse.

Der Bioconductor ...

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